近日，重庆理工大学数学科学研究中心助理教授刘健博士与美国密歇根州立大学Guo-Wei Wei讲席教授和博士后陈冬合作的题为TopoFormer: Multiscale Topology-enabled Structure-to-Sequence Transformer for Protein-Ligand Interaction Predictions研究成果，在人工智能领域期刊《Nature Machine Intelligence》（IF:25.898）上发表。

  据悉，《Nature Machine Intelligence》是《Nature》期刊于2019年创立的子刊。该期刊在影响因子（Impact Factor）和谷歌指数（H-Index）方面均列前茅，覆盖计算生物学、模式识别、图像处理和计算机视觉等多个领域。

  拓扑大语言模型示意图。

  该论文提出了一种创新的工具——TopoFormer，结合了大语言模型（LLM）与多尺度拓扑技术，用于预测蛋白质-配体相互作用。